Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms