Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2bQ7TPM1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms