Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shq1Q7TMX5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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