Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trappc6aQ78XR0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc6aQ78XR0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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