Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sys1Q78S06 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms