Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Eci3Q78JN3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms