Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mindy1Q76LS9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mindy1Q76LS9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mindy1Q76LS9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mindy1Q76LS9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mindy1Q76LS9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mindy1Q76LS9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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