Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1cQ76I25 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms