Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms