Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms