Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms