Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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