Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2bQ64511 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms