Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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