Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Irf4Q64287 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irf4Q64287 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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