Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Spa17Q62252 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spa17Q62252 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Spa17Q62252 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spa17Q62252 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms