Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ifi47Q61635 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifi47Q61635 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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