Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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