Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp7Q60973 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms