Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cnot7Q60809 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cnot7Q60809 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cnot7Q60809 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cnot7Q60809 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot7Q60809 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms