Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms