Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bbs12Q5SUD9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms