Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmprss11eQ5S248 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmprss11eQ5S248 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms