Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Taf3Q5HZG4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Taf3Q5HZG4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms