Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms