Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrmoQ562D6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrmoQ562D6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms