Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf38aQ4FK66 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms