Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
D130052B06RikQ3UW13 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms