Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SbsponQ3UPR9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SbsponQ3UPR9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms