Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms