Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edc4Q3UJB9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms