Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U595 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U595 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms