Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms