Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hace1Q3U0D9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms