Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Prr27Q3SYJ2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Prr27Q3SYJ2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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