Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col24a1Q30D77 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col24a1Q30D77 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms