Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gbp8Q2V6D6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gbp8Q2V6D6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gbp8Q2V6D6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gbp8Q2V6D6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gbp8Q2V6D6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbp8Q2V6D6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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