Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Shroom4Q1W617 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms