Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ptcd3Q14C51 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ptcd3Q14C51 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ptcd3Q14C51 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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