Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms