Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rundc1Q0VDN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms