Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem52bQ0VBF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem52bQ0VBF2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms