Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ttc21bQ0HA38 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ttc21bQ0HA38 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc21bQ0HA38 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms