Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms