Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MitfQ08874 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms