Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms