Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
AmbpQ07456 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms