Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms