Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms