Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms